Le recensement est placé sous la tutelle du ministère de l'Économie et des Finances, chargé de l'Industrie, et mis en œuvre par l'Institut National des Statistiques de Djibouti (INSTAD). Plus de 1 550 agents sont mobilisés pour effectuer le dénombrement de la population dans la capitale et les régions de l'intérieur.

Les résultats de ce troisième recensement permettront d'obtenir des données récentes, de mettre en place une cartographie et une banque de données sur l'ensemble des quartiers, maisons et infrastructures communautaires. L'objectif stratégique de ce recensement est de fournir au pays des données actualisées sur l'effectif et les caractéristiques distinctes de sa démographie, afin de planifier et de suivre l'évaluation des politiques, programmes et projets de développement. Le dernier recensement remonte à 2009.

Ce recensement est exhaustif et concerne également les populations de réfugiés et de demandeurs d'asile vivant en République de Djibouti. Le Haut-Commissariat des Nations Unies pour les Réfugiés (HCR) a salué cette démarche et a mobilisé ses équipes des bureaux et unités du HCR d'Ali-Sabieh et d'Obock pour assurer le suivi de l'enregistrement des réfugiés et des demandeurs d'asile dans les villages de réfugiés. Les équipes du HCR se tiennent prêtes à apporter tout l'appui nécessaire à l'équipe du RGPH-3 durant le recensement dans les sites des réfugiés.